La série débute quelques temps après le tournoi Ragnarok, qui s'est déroulé à Centrado 200 ans dans le futur. Le tournoi Football Frontier International Vision 2 (parfois abrégé FFIV2) est sur le point de débuter. Arion Sherwind et ses amis Riccardo Di Rigo et Victor Blade furent sélectionnés pour faire partie de l'équipe Inazuma National. Pendant qu'ils s'attendaient à jouer dans cette équipe avec leurs coéquipiers de l'équipe de football de Raimon, il n'en fut rien. L'entraineur Astero Black recruta huit autres joueurs, qui s'avèrent n'avoir jamais joué au football. Pourquoi donc l'entraineur Black a-t-il choisi ces joueurs-là ? Qui est-il vraiment ?

Mark Evans est un élève joyeux et plein d’entrain de seconde année au collège Raimon. Il est également le capitaine de l’équipe de football de son collège, où il joue en tant que gardien de but. Il fut un jour où Nelly Raimon, la fille du président du conseil d’administration du collège, menaça le club de sa dissolution si l’équipe ne remportait pas un match amical contre la prestigieuse équipe de la Royal Academy, la meilleure du Japon. Seulement, l’équipe de Raimon ne comporte que sept joueurs, un nombre insuffisant pour jouer un match. Mark essaya de sauver le club en recrutant quatre autres joueurs.